Pesquisadores da Universidade Estadual de Campinas (Unicamp) e colaboradores desenvolveram o CellForgeR, uma ferramenta on-line gratuita para analisar dados de expressão gênica em células individuais. Segundo a Agência FAPESP, a plataforma pode ser usada por pesquisadores sem experiência em programação e foi apresentada como a primeira desse tipo desenvolvida no Brasil. Agência FAPESP
A ferramenta trabalha com dados de sequenciamento de RNA de célula única, técnica que identifica quais genes estão expressos em cada célula, em vez de analisar apenas o conjunto de células de um tecido. Esse nível de detalhamento permite investigar, por exemplo, diferentes estados celulares em macrófagos e adipócitos, temas relevantes para estudos de doenças metabólicas, explica Marcelo Mori, professor do Instituto de Biologia da Unicamp e participante do desenvolvimento. Agência FAPESP
O CellForgeR é acessado pelo navegador e funciona no Cluster Científico do Instituto de Biologia da Unicamp, sem instalação no computador do usuário. O pesquisador pode usar dados próprios ou disponíveis na internet e selecionar parâmetros, tipos celulares e genes por menus e botões. De acordo com Diogo de Moraes, pesquisador da Universidade Estadual Paulista (Unesp) e um dos criadores, a ferramenta busca reduzir barreiras técnicas e de custo associadas à análise de grandes volumes de dados. Agência FAPESP
A equipe reúne pesquisadores da Unicamp, da Unesp e da Universidade de São Paulo (USP). Interessados podem acessar a plataforma pelo site indicado pela Agência FAPESP; para contatar a equipe, a reportagem informa o e-mail [email protected]. Os laboratórios envolvidos também planejam oferecer treinamentos sobre análise de dados de sequenciamento de células únicas, mas a fonte não informa datas ou inscrições. Agência FAPESP
Fontes consultadas
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